员工因未签劳动合同进行恶意劳动仲裁，公司该

公司应积极应对恶意劳动仲裁，证明劳动关系存在。依据《劳动和社会保障部关于确立劳动关系有关事项的通知》，可凭工资支付凭证、社保记录等证明。不及时处理可能导致公司承担不必要的赔偿责任，损害公司声誉。
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应对恶意仲裁，公司应：1.收集证据，如工资单、考勤记录等，证明劳动关系；2.若证据确凿，直接准备应诉材料；3.若证据不足，尝试与劳动者沟通，了解诉求，寻求和解；4.必要时请专业律师协助，确保权益不受损害。
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处理此类问题，公司可收集劳动关系证据，与劳动者协商或积极应诉。选择方式需根据具体情况，如证据充分则直接应诉，证据不足则先与劳动者沟通协商。